山东大学基础医学院药理学系始建于齐鲁大学医学院和华东白求恩医学院。20世纪三、四十年代齐鲁大学医学院开设药理学科。1948年华东白求恩医学院迁入济南，开始筹建药理学教研室，由陈牧群讲师临时负责。山东省立医学院1948年11月并入华东白求恩医学院。1950年华东白求恩医学院更名山东医学院。1950年2月，周廷冲教授（后为中国科学院院士）任教研室主任，1952年9月全国院系调整，山东医学院与齐鲁大学医学院合并成立山东医学院，仍由周廷冲教授任药理学教研室主任。1953年周廷冲教授奉调军事医学科学院，黄文兴讲师任教研室副主任。1958年改由吴葆杰讲师任教研室副主任，1966年增补曲钧庆讲师为教研室副主任。1969年学校开门办学，药理学教研室分散于四个大队。1972年回济南后，由吴葆杰讲师任教研室主任，曲钧庆讲师任副主任。1975年曲钧庆讲师调山东医学院楼德分院（后迁泰安市改为泰山医学院）。1978年由基础医学部主任吴葆杰副教授兼任药理学教研室主任，于常平讲师为副主任，1979年增补黄文兴副教授为副主任(列于常平之前)。1985年山东医学院更名山东医科大学，吴葆杰教授任药理学教研室主任，周序斌讲师任副主任。1991年周序斌副教授任教研室主任，张岫美讲师、王景梓讲师任副主任。1996年张岫美教授任教研室主任，丁华副教授任副主任。2000年7月，原山东医科大学与原山东大学、原山东工业大学合并，成立新山东大学，2000年12月成立山东大学医学院。2001年9月，设立医学院药理学研究所，张岫美教授任研究所所长，丁华教授任副所长。2008年4月张岫美教授任研究所所长，王立祥副教授任副所长，2010年5月增补易凡教授为副所长。2013年1月易凡教授兼任研究所所长，王立祥副教授、刘慧青副教授任副所长。2021年1月刘慧青教授任药理学系主任，张斌副教授、王姿颖副教授和谢玉生教授任副主任。

药理学系自建立以来，经过不断充实和提高，已发展成为师资力量较雄厚，能够培养高层次人才和承担大型前沿性科学研究的教学及研究单位。研究所设心、脑血管药理学研究室、肾病与免疫药理学研究室、神经与肿瘤药理学研究室、分子生物学实验室等。学系现有教授3人（包括国家杰出青年基金获得者易凡教授和青年泰山学者谢玉生教授），副教授11人，讲师2人。博士生导师3人，硕士生导师9人。学系先后选派教师20余人次赴美国、日本、瑞典、加拿大、爱尔兰等国学习进修，教师大多具有海外学习经历。

学系全体教师忠诚教育事业，以严谨的治学态度，出色地完成了各专业和层次的教学任务。目前，学系每年承担4个学院包括五、七、八年制临床医学、八年制口腔医学、护理学、预防医学、口腔医学和MBBS留学生等学生的药理学、心血管药理学及临床药理学课程。1990年起，为博士、硕士学位研究生开设了心血管药理学、临床药理学、神经药理学、化学治疗学和免疫药理学等课程，自1993年起，为高年级学生开设了临床药理学和心血管药理学选修课，自2010年起，开设全校通识课药你健康。

药理学系1978年成为我国第一批硕士学位授权点并开始培养硕士学位研究生；2003年分别获药理学（药学）和医学基础药理学（基础医学）博士学位授予权，2002年开始招收博士研究生。毕业的硕士和博士研究生在教学和科研方面都做出了突出的贡献。

自20世纪五十年代起，受卫生部和山东省卫生厅的委托，药理学系开始举办各种师资培训班，其中高级药理师资班3期22人，中级药理师资班7期121人，接受进修生102人,他们分布在全国各地，成为药理学教学和科学研究的骨干力量。

学系历来重视科学研究，曾先后研究了中草药、抗疟药、抗丝虫病药、抗高血压药及计划生育用药等，还进行了农药的毒理学研究。20世纪七十年代初期开始，吴葆杰教授在总结过去科研工作成绩和经验的基础上，确定了以心、脑血管药理学为主的研究方向。经过多年的探索，研究所逐步形成了以缺血性脑血管病发生发展机制及防治药物研发为特色及肾病与免疫药理学等研究方向，建立了本所科学研究的学术特点，取得了较大的成绩。承担并完成国家自然科学基金、博士点基金、山东省自然科学基金、国内贸易部、山东省科技厅、山东省卫生厅、山东省教育厅、山东省计生委、山东省体育局等研究项目，还与企业和高等学校合作完成了多项新药的研发。学系目前的主要研究内容包括：①肾脏病发病机制的研究：重点聚焦于区域免疫调控、糖脂代谢稳态调控以及表观遗传调控在肾脏中的作用, 以期发现具有潜在临床应用价值的关键分子，用于肾脏相关疾病的诊断和治疗；②神经药理学和心脑血管药理学：主要致力于缺血性脑血管疾病和帕金森病的发病机制及相关神经保护药物研究；③肿瘤药理学：主要集中在免疫微环境与肿瘤治疗、肿瘤相关基因的分子生物学研究及抗肿瘤药物的筛选、检测及机制研究及抗肿瘤药物纳米载药系统的研究；④应用活性光交联标记探针、荧光探针等化学工具箱，结合活性蛋白质组分析及荧光成像，研究蛋白质翻译后修饰及其“Writers”, “Erasers” , “Readers”；基于碎片重组、理性设计、蛋白降解靶向嵌合体等，结合化学蛋白质组学，设计靶向翻译后修饰调节因子，Hedgehog、Autophagy通路，肿瘤免疫治疗等的小分子调节剂。

学系自建立以来逐步发展壮大，培养了大批高水平的药理学专业人才，取得了一定的成绩。目前，全所教师正奋发进取，为进一步提高教学质量和科研水平而努力工作。